| 編號 | 科名 | 學名 | 中文名 | 習性 | 室內 | 庭園 | 校園 | 公園綠地 | 行道樹 |
| 1 | 大風子科 | Homalium cochinchinensis (Lour.) Druce | 天料木 | 喬木 | | | | | V |
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| 2 | 大戟科 | Bischofia javanica Blume | 茄苳 | 喬木 | | | | | V |
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| 大戟科 |
| Drypetes karapinensis (Hayata) Pax |
| 交力坪鐵色 | 喬木 | | V | V | V | |
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| 4 | 大戟科 | Drypetes littoralis (C. B. Rob.) Merr. | 鐵色 | 喬木 | V | V | | | |
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| 5 | 大戟科 | Liodendron formosanum (Kanehira & Sasaki) Keng | 臺灣假黃楊 | 喬木 | V | V | | | |
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| 大戟科 |
| Suregada aequorea (Hance) Seem. |
| 白樹仔 | 喬木 | | | V | V | |
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| 小蘗科 |
| Mahonia oiwakensis Hayata |
| 阿里山十大功勞 | 灌木 | V | V | | | |
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| 山柑科 |
| Crateva adansonii DC. subsp. formosensis Jacobs |
| 魚木 | 喬木 | | | | | V |
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| Palaquium formosanum Hayata |
| | 喬木 | | | | | V |
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| 山欖科 | 大葉山欖 |
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| 10 | 山欖科 | Planchonella obovata (R. Br.) Pierre | 
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| | | | V |
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| 天南星科 |
| 石菖蒲 | | | | | | |
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| 草本 | V |
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| 天南星科 |
| Schismatoglottis kotoensis (Hayata) T. C. Huang, J. L. Hsiao & H. Y. Yeh |
| 蘭嶼芋 |
| | V | | | |
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| 13 | | Jasminum nervosum Lour. | | 藤木 |
| V | V | | |
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| 木犀科 | 山素英 |
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| 木蘭科 |
| Michelia compressa (Maxim.) Sargent var. lanyuensis S. Y. Lu et al. |
| 蘭嶼烏心石 | 喬木 | | | | | V |
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| Molineria capitulata (Lour.) Herb. |
| | 草本 | V | | | | |
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| 仙茅科 | 大仙茅 |
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| 16 | 冬青科 | Ilex asprella (Hook. & Arn.) Champ. | 燈稱花 | 灌木 | | V | V | | |
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| | 喬木 | | | V | V | |
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| 冬青科 | 圓葉冬青 |
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| 冬青科 |
| 鐵冬青 | 喬木 | | | V | V | V |
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| Barringtonia asiatica (L.) Kurz |
| | 喬木 | | | | V | |
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| 玉蕊科 | 棋盤腳樹 |
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| 20 | 玉蕊科 | Barringtonia racemosa (L.) Blume & DC. | 穗花棋盤腳 | 喬木 | | | | | V |
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| 21 | 禾本科 | Pogonatherum crinitum (Thunb.) Kunth | 金絲草 | 草本 | V | | | | |
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| 百合科 |
| Aspidistra attenuata Hayata |
| 薄葉蜘蛛抱蛋 | 草本 | V | V | | | |
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| 23 | 百合科 | Aspidistra daibuensis Hayata | 大武蜘蛛抱蛋 | 草本 | V | V | | | |
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| 百合科 |
| Aspidistra elatior Blume var. attenuata (Hayata) S. S. Ying |
| 臺灣蜘蛛抱蛋 | 草本 | V | V | | | |
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| Liriope spicata (Thunb.) Lour. |
| | 草本 | V | V | | | |
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| 百合科 | 麥門冬 |
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| 百合科 |
| Ophiopogon reversus C. C. Huang |
| 高節沿階草 | 草本 | V | V | | | |
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| | 草本 | V | V | | | |
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| 百合科 | 高氏球子草 |
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| Peliosanthes macrostegia Hance |
| | 草本 | V | V | | | |
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| 百合科 | 矮球子草 |
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| 百合科 |
| Ypsilandra thibetica Franch. |
| 丫蕊花 | 草本 | V | | | | |
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| 30 | 肉豆蔻科 | Myristica ceylanica A. DC. var. cagayanensis (Merr.) J. Sinclair | 蘭嶼肉豆蔻 | 喬木 | | | | | V |
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| Viburnum odoratissimum Ker |
| | 灌木 | | V | V | | |
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| 忍冬科 | 珊瑚樹 |
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| 杜英科 |
| Elaeocarpus decipiens Hemsl. |
| 杜英 | 喬木 | | | V | V | V |
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| Elaeocarpus japonicus Siebold & Zucc. |
| | 喬木 | | | V | V | V |
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| 杜英科 | 薯豆 |
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| 34 | | Vaccinium bracteatum Thunb. | | 灌木 | | | V | V | |
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| 杜鵑花科 | 米飯花 |
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| 35 | 豆科 | Ormosia formosana Kanehira | 臺灣紅豆樹 | 喬木 | | | | | V |
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| 芸香科 |
| Acronychia pedunculata (L.) Miq. |
| 降真香 | 喬木 | | | V | V | |
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| Citrus tachibana (Makino) Tanaka |
| | 灌木 | | | | V | |
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| 芸香科 | 橘柑 |
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| 38 | 金粟蘭科 | Sarcandra glabra (Thunb.) Nakai |
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| V | | | |
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| 藤黃科 |
| Calophyllum inophyllum L. |
| 瓊崖海棠 | | | | | | V |
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| 喬木 |
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| 40 | 金縷梅科 | Distylium racemosum Siebold & Zucc. | 蚊母樹 | 喬木 | | | V | V | |
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| 41 | 金縷梅科 | Eustigma oblongifolium Gardn. & Champ. | 秀柱花 | 喬木 | | | V | V | V |
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| 42 | 柿樹科 | Diospyros ferrea (Willd.) Bakh. f. | 象牙柿 | 灌木 | | V | | | |
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| 柿樹科 |
| Diospyros eriantha Champ. & Benth. |
| 軟毛柿 | 喬木 | | V | V | V | |
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| 44 | 柿樹科 | Diospyros kotoensis Yamazaki | 蘭嶼柿 | 喬木 | V | V | | | |
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| 柿樹科 |
| 黃心柿 | 喬木 | V | V | | | |
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| 46 | 柿樹科 | Diospyros philippensis (Desr.) Gurke | 毛柿 | 喬木 | | | | | V |
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| 柿樹科 |
| Diospyros vaccinioides Lindly |
| 楓港柿 | 喬木 | | V | V | V | |
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| 48 | | Euscaphis japonica (Thunb.) Kanitz | | 喬木 | | | | | V |
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| 省沽油科 | 野鴉椿 |
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| 49 | 秋海棠科 | Begonia fenicis Merr. | 蘭嶼秋海棠 | 草本 | V | V | | | |
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| 秋海棠科 |
| Begonia formosana (Hayata) Masam. |
| 水鴨腳 | 草本 | V | V | | | |
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| 51 | | Begonia longifolia Blume |
| 草本 |
| V | | | |
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| 秋海棠科 | 圓果秋海棠 |
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| 秋海棠科 |
| Begonia nantoensis Lai & Chung |
| 南投秋海棠 | 草本 | V | V | | | |
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| 胡椒科 |
| 臺灣椒草 | 草本 | V | V | | | |
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| | 草本 | V | V | | | |
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| 胡椒科 | 紅莖椒草 |
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| 唇形科 |
| Salvia nipponica Miq. var. formosana (Hayata) Kudo |
| 黃花鼠尾草 | 草本 | | V | V | | |
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| Tricalysia dubia (Lindl.) Ohwi |
| | 喬木 | | V | V | | |
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| 茜草科 | 狗骨仔 |
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| 57 | 茶科 | Adinandra milletii Benth. & Hook. f. & Hance var. formosana (Hay.) Kobuski | 臺灣楊桐 | 喬木 | | V | V | | |
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| Camellia brevistyla (Hayata) Cohen-Stuart |
| | 喬木 | | | V | V | |
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| 茶科 | 短柱山茶 |
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| 59 | 茶科 | Camellia furfuracea (Merr.) Cohen-Stuart |
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| | V | V | |
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| 茶科 |
| Camellia hengchunensis C. E. Chang |
| 恆春山茶 | | | | V | V | V |
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| 喬木 |
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| 茶科 |
| Cleyera japonica Thunb. var. morii (Yamamoto) Masamune |
| 森氏紅淡比 | 喬木 | | | | | V |
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| 62 | 茶科 | Eurya emarginata (Thunb.) Makino | 凹葉柃木 | 喬木 | | V | V | V | |
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| 63 | 茶科 | Eurya nanjenshanensis (Hsieh, Ling , & Yang) S. Z. Yang & S. Y. Lu | 南仁山柃木 | 灌木 | | | V | V | |
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| 64 | 茶科 | Pyrenaria buisanensis (Sasaki) C. F. Hsieh, Yang and S. Z. Ya & M. H. Su | 武威山烏皮茶 | 喬木 | | | | | V |
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| 65 | 茶科 | Pyrenaria shinkoensis (Hayata) Keng | 烏皮茶 | 喬木 | | | | | V |
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| 66 | 茶科 | Schima superba Gard. & Champ. | 木荷 | 喬木 | | | | | V |
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| 67 | 茶科 | Schima superba Gard. & Champ. var. kankaoensis (Hayata) Keng | 港口木荷 | 喬木 | | | | | V |
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| 68 | 茶科 | Ternstroemia gymnanthera (Wight & Arn.) Sprague | 厚皮香 | 喬木 | | V | V | V | |
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| | 草本 | | V | V | | |
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| 蚌殼蕨科 | 臺灣金狗毛蕨 |
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| 灌木 |
| V | V | | |
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| 馬錢科 | 灰莉 |
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| 梧桐科 |
| Reevesia formosana Sprague |
| 臺灣梭羅樹 | 喬木 | | | V | V | V |
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| 72 | | Bredia gibba Ohwi | | 灌木 |
| V | | | |
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| 野牡丹科 | 小金石榴 |
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| 73 | 野牡丹科 | Bredia hirsuta Bl. var. rotundifolia (Liu & Lu) S. F. Huang & T. C. Huang | 圓葉布勒德藤 | 灌木 | V | V | | | |
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| 74 | 野牡丹科 | Bredia oldhamii Hook. f. | 金石榴 | 灌木 | V | V | | | |
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| 75 | 野牡丹科 | Medinilla formosana Hayata | 臺灣野牡丹藤 | 灌木 | | V | V | | |
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| V | | | V |
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| 棕櫚科 | 臺灣海棗 |
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| 77 | 殼斗科 | Castanopsis formosana (Skan) Hayata |
| 喬木 | | | | | V |
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| 78 | 殼斗科 | Cyclobalanopsis pachyloma (Seemen) Schottky | 捲斗櫟 | 喬木 | | | V | V | V |
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| 殼斗科 |
| Lithocarpus konishii (Hayata) Hayata |
| 油葉石櫟 | 喬木 | | | V | V | V |
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| 紫金牛科 |
| Ardisia brevicaulis Diels |
| 屯鹿紫金牛 | 灌木 | V | V | | | |
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| 81 | 紫金牛科 | Ardisia chinensis Benth. | 華紫金牛 | 灌木 | V | V | | | |
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| 82 | 紫金牛科 | Ardisia cornudentata Mez | 雨傘仔 | 灌木 | V | V | | | |
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| 紫金牛科 |
| Ardisia cornudentata Mez subsp. morrisonensis (Hayata) Yang |
| 玉山紫金牛 | 灌木 | V | V | | | |
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| 紫金牛科 |
| Ardisia cornudentata Mez subsp. morrisonensis (Hayata) Yang var. stenosepala (Hayata) Yang |
| 阿里山紫金牛 | 灌木 | V | V | | | |
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| 85 | | Ardisia crenata Sims | | 灌木 | V | V | | | |
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| 紫金牛科 | 珠砂根 |
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| 86 | 紫金牛科 | Ardisia crenata Sims var. miaoliensis Lu | 苗栗紫金牛 | 灌木 | V | V | | | |
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| 87 | 紫金牛科 | Ardisia quinquegona Bl. | 小葉樹杞 | 喬木 | V | V | | | |
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| 88 | 紫金牛科 | Ardisia virens Kurz |
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| V | | | |
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| 紫金牛科 |
| Myrsine sequinii H. L'evl. |
| 大明橘 | | | | | | V |
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| 喬木 |
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| 紫草科 |
| Tournefortia argentea L. f. |
| 白水木 | 喬木 | | V | | | |
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| 91 | | Cinnamomum kotoense Kanehira & Sasaki |
| 喬木 |
| V | V | | |
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| 樟科 | 蘭嶼肉桂 |
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| 樟科 |
| Cinnamomum osmophloeum Kanehira |
| 土肉桂 | 喬木 | | | V | V | |
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| 93 | 樟科 | Neolitsea aurata (Hayata) Koidz. |
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| | V | V | |
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| 蓮葉桐科 |
| Hernandia nymphiifolia (Presl) Kubitzki |
| 蓮葉桐 | | | | | V | V |
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| 喬木 |
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| Alpinia intermedia Gagnep. |
| | 草本 | | V | V | V | |
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| 薑科 | 山月桃 |
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| 薑科 |
| 普萊氏月桃 | 草本 | | V | V | V | |
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| 97 | | Alpinia shimadae Hayata | | 草本 | | V | V | V | |
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| 薑科 | 島田氏月桃 |
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| 98 | 薑科 | Alpinia shimadae Hayata var. kawakamii (Hayata) J. J. Yang & J. C. Wang | 川上氏月桃 | 草本 | | V | V | V | |
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| 薑科 |
| 烏來月桃 | 草本 | | V | V | V | |
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| 100 | | Alpinia tonrokuensis Hayata | | 草本 | | V | V | V | |
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| 薑科 | 屯鹿月桃 |
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| 101 | 薔薇科 | Prunus phaeosticta (Hance) Maxim. | 墨點櫻桃 | 喬木 | | | V | V | |
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| 102 | 薔薇科 | Prunus spinulosa Sieb. & Zucc. | 刺葉桂櫻 | 喬木 | | | V | V | |
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| 薔薇科 |
| Pyracantha koidzumii (Hayata) Rehder |
| 臺灣火刺木 | 灌木 | | V | | | |
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| 104 | 羅漢松科 | Nageia nagi (Thunb.) O. Ktze. | 竹柏 | 喬木 | V | V | | | |
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| 羅漢松科 |
| Podocarpus costalis Presl |
| 蘭嶼羅漢松 | 喬木 | | V | | | |
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| 106 | 羅漢松科 | Podocarpus nakaii Hayata | 桃實百日青 | 喬木 | | | | | V |
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